Título del proyecto: Validación prospectiva de alteraciones en cr 1q y cr 16q como biomarcadores en Sarcoma de Ewing
Investigador principal: Dr. Enrique de Álava.
Lugar: Laboratorio de Patología Molecular de Sarcomas Hospital Universitario Virgen del Rocío-Instituto de Biomedicina de Sevilla
Fechas: Enero 2014-Enero 2017
Medios: 150.000 €
La Fundación María García-Estrada ha firmado su sexta línea de investigación en sarcoma, la continuación de la línea anterior, que ya ha obtenido resultados muy esperanzadores.
A raíz de esa línea nace el nuevo proyecto, del que también es investigador principal el Dr. Enrique de Alava, con el título ‘Validación prospectiva de alteraciones en cr 1q y cr 16q como biomarcadores en Sarcoma de Ewing’.
Ha comenzado en enero de 2014 en el Laboratorio de Patología Molecular de Sarcomas en el Hospital Universitario Virgen del Rocío-Instituto de Biomedicina de Sevilla. Tendrá una duración de 3 años, finalizando en enero de 2017.
El proyecto se ha aprobado con un presupuesto de CIENTO CINCUENTA MIL EUROS ( 150.000,00 €), desglosado en tres anualidades de 50.000,00 €.
Esta propuesta se encuadra dentro del consorcio Europeo Provabes (http://provabes.uni-muenster.de/), que agrupa a cinco de los grupos europeos más competitivos en la investigación del SE. Este consorcio está dedicado específicamente a la validación prospectiva de biomarcadores en pacientes de SE incluidos en los ensayos clínicos de EuroEwing. El estudio será complementado por otros grupos europeos incluidos en el consorcio y que realizarán secuenciación de exomas y estudios GWAS (Genome-Wide Association Studies).
RESUMEN (Objetivos y metodología del proyecto)
El sarcoma de Ewing (SE) fue la primera enfermedad maligna sólida definida por la presencia de translocaciones y fusiones de genes (principalmente EWSR1-FLI1). En un estudio prospectivo reciente, con el mayor número de pacientes estudiados hasta la fecha, se demostró que la variante molecular de fusión EWS-FLI1 no tiene impacto pronóstico. Esto contrasta con los estudios retrospectivos anteriores, que sugerían una posible ventaja en la supervivencia sin recaída para pacientes con fusiones EWSR1-FLI1 de tipo 1, poniendo de relieve la importancia de la validación prospectiva de marcadores. Nuestra hipótesis es que las alteraciones genéticas secundarias pueden contribuir a explicar las formas más agresivas de SE, y podrían servir como biomarcadores pronósticos. Se espera que no un solo biomarcador sino más bien una combinación de marcadores proporcione el algoritmo de pronóstico más informativo para los pacientes con SE. Los resultados de un reciente estudio multicéntrico retrospectivo (publicados recientemente por los participantes en el presente proyecto) demuestran que los pacientes con SE cuyos tumores muestran una ganancia de 1q tienen un peor pronóstico, de manera independiente al estadio, al volumen tumoral, y a otros parámetros clínico- patológicos clásicos. El objetivo de esta propuesta es realizar una validación prospectiva de las ganancias de los cromosomas 1q, y de la pérdida del cromosoma 16q en muestras de pacientes con SE incluidos en el protocolo europeo EuroEwing. En concreto, evaluaremos la tecnología FISH para la validación prospectiva de las alteraciones en número de copias (ganancia de 1q y alteración 16) y, como objetivo exploratorio, realizaremos estudios prospectivos de alto rendimiento de las alteraciones de número de copias en el SE. Nuestra propuesta se enmarca dentro del consorcio europeo PROVABES, que reúne a cinco de los grupos europeos más competitivos en la investigación en SE, y que se dedica precisamente a la validación prospectiva de sendos biomarcadores en esta enfermedad.
TRAYECTORIA DEL GRUPO INVESTIGADOR
El grupo de Patología Molecular de Sarcomas (lab-PMS) está dirigido por el Dr. Enrique de Álava desde 2003. Ha estado radicado en el CIC de Salamanca hasta el verano de 2013, cuando se has trasladado al Hospital Universitario Virgen del Rocío-IBiS en Sevilla. Cuenta con cinco investigadores postdoctorales (Dr. José Luis Ordóñez, Dr. Juan Díaz, Dra. Lourdes Hontecillas, Dr. Daniel J. García y Dra. Ana T. Amaral, que leyeron sus tesis en orden cronológico entre 2003 y 2013), y un investigador pre-doctoral (Pablo Rodríguez). Además, otros tres postdoctorales se encuentran realizando formación postdoctoral en centros de reconocido prestigio.
Experiencia: Esta propuesta supone la continuidad de la línea de investigación sobre sarcoma de Ewing que el Investigador principal (IP) comenzó en los EE.UU. en 1994. De manera más directamente relacionada con el objetivo del proyecto, el IP en su etapa postdoctoral publicó los primeros análisis sistemáticos del valor pronóstico de alteraciones génicas secundarias en esta entidad: p53 (Cancer 2000;89:783-92 y Cancer 2000;89:793-9). A su vuelta a España, en el Departamento de Patología de la Clínica Universitaria de Navarra (Dr. J. Pardo) el IP colaboró en el proyecto FIS 96/2102 donde se realizó un estudio de caracterización de la variabilidad molecular en la familia de tumores de Ewing. A partir de 1999 el IP obtuvo del FIS financiación independiente para su línea de investigación centrada en nuevas dianas terapéuticas y marcadores diagnósticos del sarcoma de Ewing, mediante cinco proyectos consecutivos: 99/0646 PI020828, PI052524, PI081828, PI1100018). Desde el año 2006 el IP fue coordinador de un nodo de la Red de Excelencia de investigación en sarcomas óseos financiada por la Comisión Europea (NoE EUROBONET). En esta red, coordinó el work package de Biología Molecular del tumor de Ewing y las plataformas horizontales de proteómica e inmunohistoquímica. Fruto de estos estudios, el grupo de Patología Molecular ha encontrado entre otros los siguientes hallazgos: 1. El fármaco ADW742 inhibe in vitro la proliferación del sarcoma de Ewing, mediante la inhibición de la ruta de señalización de IGF1R (Martins et al., 2006) 2. La proteína de shock térmico HSP90 contribuye in vitro e in vivo de manera decisiva a la resistencia a los inhibidores de IGF1R (Martins AS, et al. 2008; patente). 3. Mediante estudios de interferencia con shRNAi se ha identificado una nueva diana de EWS-FLI1 denominada TOPK (Herrero-Martín D, et al., 2009). 4. La endocitosis dependiente de CAV1/Clatrina tiene un impacto relevante en la señalización a través de IGF1R (Martins et al. Plos One). 5. Se ha caracterizado un grupo de pacientes de Sarcoma de Ewing con recidivas y metástasis cuyos tumores presentan ganancias de 1q (1gG) y desregulación del ciclo celular. La sobreexpresión de DTL parece explicar en parte ese fenotipo (Mackintosh et al. Oncogene, 2012). 6. Hemos evaluado un fármaco dirigido contra una de las proteínas relacionadas con los efectos funcionales más notables de la ganancia 1q (Mackintosh, García Domínguez et al., Oncogene 2013). En el desarrollo de todos estos estudios, hemos utilizado un amplio abanico de técnicas de Biología Molecular entre otras (RT-PCR, Western blotting, citometría de flujo, immunoprecipitación, transfección, siRNA, soft agar y ensayos de movilidad, arrays de expresión, real-time PCR, ChiP, estudios in vivo, etc.).
